反恐特战队队长钟原在执行任务中，击毙猛犸组织二号人物引来复仇。在解救妻子赵欣的行动中钟原被注射病毒倍受折磨。DK生物公司董事长江寒邀请初恋情人、生化专业高材生的赵欣及其父亲参加公司“有益菌”研究。反恐指挥中心根据T国请求选派“专家”潜入公司。痛失爱子的赵欣主动请缨“退出现役”、深入虎穴。接二连三的恐怖事件，使“新纪元计划”逐渐浮出水面。被病痛折磨的钟原率领乔大鹏、麦萌萌等特战队员绝地出击，在爱妻赵欣和五年前“失踪”的战友陆豪的配合下，成功粉碎了恐怖组织连环阴谋和生化袭击，揭开了江寒以“有益菌”为载体制造病毒的真实面目。

秦晓阳和唐石是从小一起长大的“铁哥们”，一次偶然事件使两人走进分属两个对决阵营。秦晓阳意外获得“密钥”并应征入伍来到以计算机信息化网络人才为主要强军目标的“天狼”特战队，在网络高手朱丽彤的配合下潜入国际恐怖组织暗网平台“地狱之门”，并与一直深爱的大数据专家姜玫、特战队员段宇哲以及老一代反恐精英一起，与恐怖分子集团斗智斗勇，挫败了一次次恐怖事件，最后在唐石的帮助下一举摧毁暗网平台，打击了国际恐怖组织。

跟随“大哥”老九常年奔波于剧组送盒饭的纯种屌丝王小军,因为欠债难还而黄粱一梦,历经生死变身挥金如土的豪放土豪,一梦醒来,却身处喧闹的KTV本想来此装一把有钱人的王小军却因为给不出小姐的台费惨遭KTV追捕。与此同时,因为陷入同父异母娘炮弟弟李天爽设下的圈套,正牌冷面土豪李天豪也霸气登场,直接在KTV惹恼企图并购公司的老板黄鹤。意图吞下李家财产的两人合力出招,放出萝莉杀手,决心绑架李天豪。KTV仓库之中,仓皇躲避杀手的李天豪撞上了被捉拿归案倒吊于此的王小军,不管缘由的换上了他的衣服继续逃窜,却阴差阳错的坐上了老九的车,一路惨遭臭鞋暴打不说,还因为老九的贪恋美色带上了杀手一同回到王小军住地。因为赌气喝下飞哥给李天豪准备的“春心萌动大补酒”,白富美孟甜甜晕晕乎乎的找到了王小军,错认成自己一心想嫁的李天豪,豪放地在仓库里和他玩起了SM游戏。

黑日组织在国际股市移走了500亿美元资金，企图用这笔资金进行恐怖活动经费并且栽赃中国。神鹰反恐特战队将计就计，启动R4行动。在杨灿、那敏、柳诗文等潜伏人员和厉剑锋带领的特战队员的完美配合下，粉碎了敌人。